В вопросах подобного типа в первой части следует повествовательное предложение, а затем вопросительная часть. Причем вопросительная конструкция является противоположной повествовательной: если предложение утвердительное, то вопросительная часть отрицательная и наоборот. Вспомогательный глагол в вопросе соответствует основному предложению.
В данном случае предложение утвердительное с использованием конструкции have got to (вспомогательный глагол have), поэтому верно сказать: We have got to pay, haven`t we?